Une étude a été réalisée sous forme d’un diagnostic piscicole de la Vingeanne et de ses affluents. Cette étude a été voulue, dès 2005, par l’APPMA de la haute et moyenne Vingeanne et la fédération de pêche de la Côte d’Or et réalisée par les agents de l’office national de l’eau et des milieux aquatiques (ONEMA). Cette étude a été présentée par Laurent Perrin agent technique et Anne Laure Borderelle ingénieur de l’ONEMA. Cette étude a été élaborée pour une somme de 45 000 € financé à 50% par l’Agence de l’eau, 15 000 € ont été à la charge du CSP devenu l’ONEMA, le reste à la charge de la Fédération de Pêche, et de AAPPM. Le travail s’est déroulé à 75% sur le terrain par le biais d’inventaires piscicoles effectués sur la Vingeanne sur un secteur, allant du Creux Janin à Cusey (52) à la confluence avec la Saône. Les objectifs de cette étude ont visé à connaitre précisément le peuplement piscicole de la Vingeanne en étudiant la qualité et la quantité de poissons présents, et d’appréhender les facteurs limitant le bon état du milieu. Il s’est agit également de faire un inventaire des frayères à brochet dans le lit majeur. Un facteur naturel important (température) et d’autres, aménagés par l’homme (ouvrages, curages, prises d’eau) limitent l’atteinte d’un bon état écologique. La Vingeanne en amont de Cusey connait des pertes dues au relief karstique, à partir de Cusey des sources apportant de l’eau froide modifient le peuplement piscicole. La présence de nombreux ouvrages sur la Vingeanne a également un impact sur ce peuplement en appauvrissant la diversité. Les affluents sont fortement dégradés. La Vingeanne connait certains dysfonctionnements physiques et biologiques. Les objectifs fixés par la directive cadre sur l’eau (bon état écologique et chimique en 2015) devront être atteints. Pour cela, un contrat de rivière va être mis en place sur l’ensemble du bassin versant.